A patologia periodontal é causada por uma reação inflamatória contra a agressão das bactérias, semelhante àquela que é estabelecida quando se faz uma ferida, abrindo uma porta para a circulação sanguínea. Investigações atuais têm relacionado a patologia periodontal com um aumento do risco de doença cardíaca, acidente vascular cerebral, doença respiratória e consequências adversas da gravidez como bebés prematuros e de baixo peso. Por outro lado existem outras doenças que pela influencia que têm no sistema imunitário podem aumentar o risco de desenvolvimento ou progressão de problemas periodontais, como é o caso da diabetes, infecção por VIH, obesidade, insuficiência renal crónica, entre outros.

À semelhança dos efeitos nocivos para a saúde geral o tabaco e o álcool também desempenham um papel importante no aparecimento e agravamento dos problemas periodontais.